Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT1

ERBIN, Erbin, humanhuman

Predictions only

Length 1,412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBINQ96RT1 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ERBINQ96RT1 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERBINQ96RT1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms