Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms