Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ITGAL-201ENST00000356798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RRN3P1Q2M238 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms