Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACADSBP45954 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACADSBP45954 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACADSBP45954 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACADSBP45954 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms