Protein–RNA interactions for Protein: P30520

ADSS, Adenylosuccinate synthetase isozyme 2, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADSSP30520 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ADSSP30520 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ADSSP30520 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms