Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HDGFL3Q9Y3E1 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms