Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAJB4Q9UDY4 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms