Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RRBP1Q9P2E9 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms