Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK5RAP3Q96JB5 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms