Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDC42EP1Q00587 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms