Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LMO4P61968 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms