Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms