Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRT9P35527 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT9P35527 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT9P35527 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT9P35527 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT9P35527 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT9P35527 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT9P35527 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT9P35527 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT9P35527 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT9P35527 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT9P35527 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT9P35527 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT9P35527 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT9P35527 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT9P35527 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT9P35527 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT9P35527 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT9P35527 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT9P35527 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT9P35527 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT9P35527 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT9P35527 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRT9P35527 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRT9P35527 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT9P35527 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT9P35527 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT9P35527 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT9P35527 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT9P35527 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT9P35527 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT9P35527 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRT9P35527 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms