Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CNTFRP26992 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CNTFRP26992 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms