Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CYP2C9P11712 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP2C9P11712 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms