Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGB3P05106 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms