Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVV-1B6SEH8 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVV-1B6SEH8 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms