Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SEMA3CQ99985 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SEMA3CQ99985 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SEMA3CQ99985 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SEMA3CQ99985 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SEMA3CQ99985 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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