Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIRT1Q96EB6 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SIRT1Q96EB6 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms