Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNT2Q6UVM3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms