Protein–RNA interactions for Protein: Q07326

PIGF, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGFQ07326 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PIGFQ07326 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms