Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPB2P35606 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPB2P35606 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
COPB2P35606 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPB2P35606 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPB2P35606 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms