Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ATP2A2P16615 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2A2P16615 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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