Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 ZNF684-202ENST00000372697 1028 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 BTF3L4-204ENST00000484036 941 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC139099.1-203ENST00000570366 607 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AL109653.2-201ENST00000625029 1065 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PSMD10P2-202ENST00000626135 819 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 LINC01358-209ENST00000635072 1114 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 HYKK-205ENST00000566332 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 HNRNPH3P1-201ENST00000431935 583 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms