Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM10L2BP0DMW5 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms