Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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