Protein–RNA interactions for Protein: Q99435

NELL2, Protein kinase C-binding protein NELL2, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL2Q99435 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NELL2Q99435 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms