Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COG3Q96JB2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG3Q96JB2 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms