Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXO38Q6PIJ6 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO38Q6PIJ6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms