Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
RTL8BQ17RB0 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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RTL8BQ17RB0 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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RTL8BQ17RB0 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RTL8BQ17RB0 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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