Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PEX2P28328 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PEX2P28328 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PEX2P28328 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PEX2P28328 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PEX2P28328 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PEX2P28328 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PEX2P28328 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PEX2P28328 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PEX2P28328 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PEX2P28328 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PEX2P28328 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PEX2P28328 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PEX2P28328 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PEX2P28328 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PEX2P28328 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PEX2P28328 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PEX2P28328 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PEX2P28328 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PEX2P28328 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PEX2P28328 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PEX2P28328 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PEX2P28328 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms