Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXD8P13378 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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