Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TOP2AP11388 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TOP2AP11388 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms