Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HOXA2O43364 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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HOXA2O43364 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HOXA2O43364 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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HOXA2O43364 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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HOXA2O43364 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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HOXA2O43364 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA2O43364 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA2O43364 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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HOXA2O43364 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HOXA2O43364 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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