Protein–RNA interactions for Protein: A5D8T8

CLEC18A, C-type lectin domain family 18 member A, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC18AA5D8T8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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CLEC18AA5D8T8 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CLEC18AA5D8T8 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CLEC18AA5D8T8 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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CLEC18AA5D8T8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CLEC18AA5D8T8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CLEC18AA5D8T8 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CLEC18AA5D8T8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CLEC18AA5D8T8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CLEC18AA5D8T8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CLEC18AA5D8T8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CLEC18AA5D8T8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CLEC18AA5D8T8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CLEC18AA5D8T8 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CLEC18AA5D8T8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CLEC18AA5D8T8 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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