Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms