Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHDC9Q8NEP7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHDC9Q8NEP7 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms