Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APTXQ7Z2E3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms