Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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PRAMEF20Q5VT98 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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PRAMEF20Q5VT98 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PRAMEF20Q5VT98 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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PRAMEF20Q5VT98 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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PRAMEF20Q5VT98 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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PRAMEF20Q5VT98 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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PRAMEF20Q5VT98 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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PRAMEF20Q5VT98 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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PRAMEF20Q5VT98 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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PRAMEF20Q5VT98 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PRAMEF20Q5VT98 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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