Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN4Q5BKX8 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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