Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 DCLK1-201ENST00000255448 5703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ABCC5-201ENST00000265586 5712 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SLIT2-212ENST00000622093 6380 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 FP565324.1-201ENST00000636427 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC091178.1-201ENST00000583447 2305 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 MYH9-201ENST00000216181 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 METTL13-201ENST00000361735 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ACAN-206ENST00000559004 7628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PAK5-203ENST00000378429 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 FER1L4-208ENST00000611673 3860 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CHMP2B-201ENST00000263780 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 COL5A2-201ENST00000374866 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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VAMP3Q15836 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC068896.1-201ENST00000494792 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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VAMP3Q15836 RGS9-203ENST00000449996 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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VAMP3Q15836 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PRKAR1A-217ENST00000589228 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 RGPD8-203ENST00000409750 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SPATA6-203ENST00000371847 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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VAMP3Q15836 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ZSCAN2-207ENST00000448803 3813 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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VAMP3Q15836 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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VAMP3Q15836 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TIAM2-203ENST00000360366 5771 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TUB-202ENST00000305253 6420 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 GPR26-201ENST00000284674 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PBX1-212ENST00000540236 6175 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 MAN2A2-201ENST00000360468 6268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SHC1-203ENST00000368449 2879 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 EIF5-205ENST00000558506 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 FAM160A1-201ENST00000435205 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 PTPRK-203ENST00000368207 4758 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 IL18BP-209ENST00000497194 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 DSCR3-201ENST00000309117 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 TRIM68-201ENST00000300747 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 ARL4C-201ENST00000339728 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
VAMP3Q15836 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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