Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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