Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 MRPL47-202ENST00000392659 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 MS4A6A-201ENST00000412309 1284 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 SLC14A1-203ENST00000415427 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 SAA2-203ENST00000526900 687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CAMK2BQ13554 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CAMK2BQ13554 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms