Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms