Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CRABP1P29762 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRABP1P29762 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms