Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGA6P23229 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms