Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF4P18085 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF4P18085 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF4P18085 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF4P18085 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF4P18085 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF4P18085 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF4P18085 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF4P18085 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF4P18085 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF4P18085 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF4P18085 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF4P18085 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF4P18085 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF4P18085 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF4P18085 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF4P18085 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF4P18085 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF4P18085 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF4P18085 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF4P18085 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARF4P18085 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARF4P18085 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF4P18085 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF4P18085 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF4P18085 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF4P18085 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF4P18085 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF4P18085 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF4P18085 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF4P18085 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF4P18085 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF4P18085 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF4P18085 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF4P18085 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF4P18085 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF4P18085 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF4P18085 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ARF4P18085 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARF4P18085 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms