Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH7

SPATA6, Spermatogenesis-associated protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA6Q9NWH7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPATA6Q9NWH7 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms