Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BCO2Q9BYV7 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms