Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRXQ9BXM0 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms